学校设有16个学院，学科设置涵盖理、工、农、医、经、管、文、法、艺术、哲学、教育等11个学科门类。现有本科招生专业73个(其中，中外合作办学专业9个，第二学士学位专业1个);一级学科硕士学位授权点30个，二级学科硕士学位授权点142个;硕士专业学位授权点16个;一级学科博士学位授权点13个，二级学科博士学位授权点80个;博士后科研流动站14个。拥有8个国家重点学科、10个上海市重点学科、7个上海高校一流学科。“化学工程与工艺”是中国大陆高校首个通过ABET认证的专业，化学是中国大陆高校首个通过中俄联合国际理科专业认证的专业，商学院全部专业通过了国际精英商学院协会(AACSB)商科教育认证。化学、材料科学、工程学、生物学与生物化学、药理学和毒理学、农业科学、计算机科学、环境科学与生态学8个学科进入ESI全球前1%，化学学科进入全球前1‰。